Đảng ủy Viện
- Bí thư: PGS. TS. Chu Kỳ Sơn
- Phó bí thư: PGS. TS. Nguyễn Thị Minh Tú
- Đảng ủy viên: TS. Nguyễn Ngọc Hoàng
Ban Lãnh đạo Viện
- Viện trưởng: PGS.TS. Chu Kỳ Sơn
- Phụ trách: Tổ chức – nhân sự; Quy hoạch phát triển; Tài chính; Cơ sở vật chất; Thi đua – khen thưởng.
- Phó Viện trưởng : PGS. TS. Nguyễn Thị Minh Tú
- Phụ trách: Đào tạo; Công tác sinh viên
- Phó Viện trưởng : PGS. TS. Trương Quốc Phong
- Phụ trách: Nghiên cứu khoa học, chuyển giao công nghệ, Hợp tác đối ngoại, Truyền thông
Công đoàn Viện
- Chủ tịch: PGS. TS. Nguyễn Thị Thảo
- Phó chủ tịch: ThS. Lê Thị Lan Chi
Trưởng bộ môn và giám đốc trung tâm
- PGS.TS. Nguyễn Lan Hương – Trưởng Bộ môn Công nghệ sinh học
- PGS. TS. Hồ Phú Hà – Trưởng Bộ môn Công nghệ thực phẩm
- TS. Vũ Hồng Sơn – Trưởng Bộ môn Quản lí chất lượng
- TS. Phạm Tuấn Anh – Trưởng Bộ môn Vi sinh – hoá sinh – sinh học phân tử
- TS. Nguyễn Ngọc Hoàng – Trưởng Bộ môn Quá trình và thiết bị CNSH-CNTP
- TS. Phạm Ngọc Hưng – Giám đốc Trung tâm đào tạo và phát triển sản phẩm thực phẩm
- TS. Nguyễn Tiến Thành – Giám đốc Trung tâm nghiên cứu và phát triển Công nghệ sinh học
Đoàn Thanh niên
- Bí thư: ThS. Phan Minh Thụy
- Phó bí thư: TS. Nguyễn Chính Nghĩa
Chi đoàn cán bộ
- Bí thư: TS. Nguyễn Văn Hưng
- Phó bí thư: TS. Nguyễn Tiến Cường